หลังจากการตายในอุบัติเหตุที่เกิดขึ้น “Independence Day 2” ระหว่างทดสอบยานรบต่อต้านเอเลี่ยนรุ่นแรกของ “กัปตันสตีฟ” นักบินของนาวิกโยธินสหรัฐ หนึ่งในผู้กอบกู้โลกจากการโจมตีของมนุษย์ต่างดาว เทคโนโลยีมนุษย์ก็ได้ก้าวล้ำขึ้นมาเรื่อยๆ จนมีทั้งการสร้างอาวุธ และพาหนะสุดไฮเทค ตลอดนักบินนาวิกโยธินสหรัฐรุ่นใหม่ๆ ที่ถูกฝึกฝนฝีมือมากยิ่งขึ้น หนึ่งในนั้นก็คือ “แจ็ค มอร์ริสัน” อดีตเด็กกำพร้า ผู้ไต่เต้าจนได้กลายเป็นนักบินรบ แต่ด้วยเพราะความผิดพลาดบางอย่าง จึงทำให้เขาถูกเนรเทศไปประจำการในฐานทัพบนดวงจันทร์ และทำหน้าที่ขับเครื่อง Moon Tug แทนขณะเดียวกัน เดวิด เลวินสัน สงครามใหม่วันบดโลก 2 ผู้เชี่ยวชาญด้านดาวเทียมและคอมพิวเตอร์จากภาคที่แล้ว ซึ่งได้เลื่อนตำแหน่งเป็นผู้อำนวยการของกองกำลัง Earth Space Defense ซึ่งมีหน้าที่ปกป้องโลกจากภัยคุกคามจากอวกาศในภาคนี้ ก็ตรวจพบสัญญาณเตือนการกลับมาของหายนะครั้งยิ่งใหญ่ที่เขาเคยเผชิญมาอีกครั้ง แต่ครั้งนี้มันช่างน่าสะพรึงกลัวยิ่งกว่า และมันอาจหมายถึงอวสานของโลกและแล้วการเผชิญหน้าระหว่างกองทัพมนุษย์แลผู้มาเยือนต่างดาวได้เริ่มขึ้น การปะทะกันของสองเผ่าพันธุ์ได้เปิดฉาก การมาของยานอวกาศขนาดยักษ์ก่อเกิดมหันตภัยการทำลายล้างไปรอบทิศ id4 ภาค 2 ผู้คนทั่วโลกต้องประสบกับการการล้มตาย จากความตั้งใจที่จะทำลายล้างเผ่าพันธุ์มนุษย์ให้สิ้นซากและเข้ายึดครองให้ได้อีกครั้ง ทางเดียวที่หยุดพวกมันได้มีเพียงสมองอันชาญฉลาดของคนเพียงไม่กี่คน และการพลีชีพของกองกำลังติดอาวุธเต็มรูปแบบ เพื่อปกป้องโลกแต่สุดท้ายแล้ว… สงครามการต่อสู้เพื่อดำรงไว้ซึ่งเผ่าพันธุ์ และการปกป้องสิ่งที่เรียว่า “บ้าน” ครั้งนี้จะเป็นอย่างไร คงต้องติดตามความคืบหน้าในภารกิจครั้งสำคัญนี้ของ “แจ็ค” และ “เดวิด” กันต่อไป